教育部硕士研究生推免高校、国家级大学生创新创业实践基地、国家级大学生校外实践教育基地、教育部临床医学“5+3”改革试点高校、安徽省高校综合改革首批试点单位、安徽省院士工作站和博士后岗位设置单位，是暨南大学、陆军军医大学博士研究生联合培养单位。
学校创建于1958年7月，由原上海第二医学院分迁和安徽医学院援建而成，1968年改称蚌埠反修医学院，1970年9月，与安徽医学院合并，改名为安徽医学院蚌埠分院，1974年6月，恢复称蚌埠医学院。
