学院前身是1988年6月创办的淮南乡镇企业职业学校；1990年1月更名为淮南科技职业学校；1993年3月，成立安徽工贸学校；2001年6月，成立安徽工贸职业技术学院，同时撤销安徽工贸学院建制。
2013年9月，学院与淮南师范学院联合培养“四年一贯制”应用型本科人才。
据2021年5月学院官网显示，学院占地面积1200亩（含山南新校区规划用地），校舍建筑面积14万平方米，实验仪器设备价值7000万元；下设8个教学系部，开设64个专业，在校生5600人，专任教师400人。
