电子式表达物质结构时有一定的.局限性，例如;O（两个三中心π键）；臭氧（三中心四电子π键）；超氧化物（三电子π键）；臭氧化物（三中心五电子π键）；二氧化碳，一氧化二氮，叠氮根N （三中心四电子π键）..等等，都不能用电子式表示其结构。
所以我们才说电子式局限性较大，只能表述一小部分物质的结构。而真正意义上的结构是不能用电子式表示的。
