1.复旦大学邯郸路校区
地址：邯郸路220号。邯郸校区或邯郸路校区，是复旦大学的主校区，通称“本部”(广义上的本部)，因位于邯郸路220号而得名。校区在杨浦区，靠近五角场。1922年私立复旦大学的大学部从徐家汇李公祠(今上海市复旦中学)迁入。1952年院系调整后，邯郸校区校园逐渐向东、向南扩展。现在邯郸校区占地922297平方米，合1383亩，分为东、南、北、中四个地区。
2.复旦大学枫林校区
地址：医学院路138号。复旦大学枫林校区是复旦大学的四大校区之一，俗称医学院校区，位于繁华的'徐家汇东侧。枫林校区因所在地徐汇区枫林桥地区而得名。枫林校区是原上海医科大学的校址，占地288亩，是复旦大学除药学院外各医学院系的所在地，包括基础医学院、公共卫生学院和护理学院。因东安路(原东庙桥路)穿越校区，枫林校区被分为东苑和西苑，此外护理学院单独位于枫林路305号。
3.复旦大学桃仙张江校区
地址：张衡路825号。张江校区是由复旦大学出资 ，上海张江(集团)有限公司出地共同建设的项目，在张江高科技园区建设“以研究和应用为主，面向产业，相对集中，资源共享”的高等教育大学校区，也是我国著名高校与国家级高科技园区联合打造上海“产学研”高地。
4.复旦大学大连新江湾城新校区
地址：淞沪路2500号。复旦大学始创于1905年，原名复旦公学，1917年定名为复旦大学。上海医科大学前身是1927年创办的国立第四中山大学医学院，1932年定名为上海医学院，1985年改名为上海医科大学。2000年，复旦大学与上海医科大学合并，组建新的复旦大学，进一步拓宽学科格局，增强办学实力，已经发展成为一所拥有哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、医学、管理学、艺术学等11个学科门类的综合性研究型大学。
