协议离婚时，如果夫妻一方或双方在公司拥有股份时，通常的做法是，夫妻共同约定一方持股，给与另一方对价补偿。如果这样约定，只需双方协议并书面明确价款及支付方式即可。但是，如果夫妻双方经过约定，决定将一方拥有的公司股权部分或全部给付另一方的，还必须符合《公司法》的相关规定。
《婚姻法司法解释(二)》规定，审理离婚案件中，涉及分割夫妻共同财产中以一方名义在有限责任公司的出资额，另一方不是该公司股东的，按以下情形分别处理：
1、夫妻双方协商一致将出资额部分或者全部转让给该股东的.配偶，过半数股东同意，其他公东明确表示放弃优先购买权的，该股东的配偶可以成为该公司股东。
2、夫妻双方就出资额转让份额和转让价格等事项协商一致后，过半数股东不同意转让，但愿意以同等价格购买出资额的，人民法院可以对转让出资所得财产进行分割。过半数股东不同意转让，也不愿意以同等价格购买该出资额的，视为其同意转让，该股东的配偶可以成为该公司股东。
